https://onlinecourses.science.psu.edu/stat504/node/180===========================================
Generalized Estimating Equations (GEE)
Assumptions:
(...)
Covariance specification.
(...)
Here are four correlation structures:
Independence - **correlation between time points is independent**
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Se o contexto for o mesmo que o do link acima (e parece ser) a correlação é entre os time points, e não entre os componentes. Aliás, a estrutura gramatical da frase também sugere isso.
Me parece que o intuito da análise é estabelecer correlações entre dados coletados (no caso, os time points), e isso é feito agrupando-os em componentes em uma matriz (no caso, uma matriz simétrica). Então, as correlações são entre os dados, e não entre os componentes.