Если я правильно понял суть Вашего вопроса, он не о значении слова Steuerung (полагаю, оно Вам хорошо известно).

Mit dieser Vorgehensweise registriert die Steuerung, welches Werkzeug eingesetzt wurde.
Смысл в следующем:
"Цель этой процедуры — зарегистрировать установленный инструмент в системе управления/СЧПУ". То есть, полагаю, физическая установка выполнена, а теперь человек сообщает машине, какой инструмент установлен (введя или выбрав идентификационный код инструмента).

Если Ваш вопрос все же о самом термине, тогда мне нечего добавить к ответам коллег: система управления/СЧПУ — варианты правильные, я считаю.