My suggestions.

I assume this is meant.

Teoria dei pilastri è un'espressione inusuale in questo contesto. Vi sono diversi riscontri nell'ambito economico-politico in riferimento all'architettura della Unione Europea. Comunque, l'espressione in quel contesto è stata sicuramente "cooptata" dal linguaggio architettonico.
Tuttavia, secondo un autorevole studioso1 sarebbe proprio il finanziamento della PESC a porre in difficoltà la tradizionale teoria dei pilastri separati, tanto che la conseguente immagine "architettonica" dell'Unione come "tempio greco" meriterebbe una revisione critica.
http://www.tesionline.com/intl/pdfpublicview.jsp?url=../__PD...

Secondo il mio parere, l'espressione nel contesto di Umberto appare "troppa" anche in Italiano, in quanto dovrebbe semplicemente indicare una struttura di pilastri o colonne. Ma visto che l'autore ha deciso di usarla, io tenterei di renderla nella traduzione.
Sinonimo attestato di Theory è system che si presta bene, a mio parere, ad indicare un sistema o una struttura architettonica.
Da qui la mia proposta che peraltro poi ho riscontrato anche in un documento che fa riferimento alla teoria dei pilastri sempre in ambito di EU

Under the 'draft Constitutional Treaty', currently discussed by the Intergovernmental Conference (IGC), the EU's pillar-based system is voted to disappear as a result of the merger of the Treaties in a unique text: the Constitutional Treaty of the EU.
http://www.cahiers.org/new/htm/articoli/alemanno_a_look.htm

Un'alternativa più plastica potrebbe essere pillar-based structure o scheme

http://encarta.msn.com/thesaurus_561590827/theory.html

see+
http://www.google.it/search?hl=it&q="theory of pillar design...
http://www.ingentaconnect.com/content/klu/jomi/2001/00000037...
About the same number if ghits as the original.