El concepto de 'back-annotate" en este contexto en parte se explica aquí.
"Back-annotation means that after synthesizing and generating the layout of your device, the real time delays are determined and put back to the original design. This will let you redo the VHDL/Verilog simulation using the real timing compared to first simulation which had no delays"

http://www.embeddedrelated.com/usenet/embedded/show/42374-1....

Aquí, aunque no encuentro del todo la explicación de back-annotate aparece como concepto distinto a re-annotate.

http://www.altium.com/files/training/Module 14 - Placement a...

http://patent.ipexl.com/JP/2000ZZDASHZZ194734.html

http://worldwide.espacenet.com/publicationDetails/biblio?CC=...

Aquí alguien explica en un contexto técnico el significado
"Sophie, when you back annotate a project you are fixing certain design paramaters such as timing, pin locations, the device used, and possibly even the specific implementation of portions of the device. If for example, you implement the design, letting the fitter pick the pin placements, i.e. you did not specify any constraints, you can back annotate the project to fix these locations and hence any future modifications will not undo these locations".


Finalmente, en esta guía de usuario de OR CAD Capture, libro de 340 pág extraordinariamente técnico, el término aparece como "back-annotate".

"El comando Back Annotate crea un fichero con una extensión .SWP y lo pone en la misma carpeta en la que está su placa. Entonces se lee el fichero"

http://ocw.bib.upct.es/pluginfile.php/8002/mod_resource/cont...

En este otro texto técnico exactamente lo mismo:
Layout puede crear un fichero de anotación inversa detallando cambios en los encapsulados (..) Usaremos Back Annotate para incorporar esta información al proyecto en Capture.

http://www.granabot.es/Modulos/dpe/Apuntes/Tema 1.4.1.pdf